Особенность этой «версии» тайной канцелярии, учреждённой ещё Петром I в 1718 году, заключалась в инкорпорации органа высшей политической полиции в структуру Сената. В ведении экспедиции находились дела о государственной измене, покушении на жизнь царствующей особы, самозванстве, оскорблении личности государя словом и делом.
Экспедиторы собирали сведения, производили аресты, вели следствие. Возглавлял Экспедицию обер-секретарь сената Степан Шешковский. Упразднена в 1801 году повелением Александра I, с передачей функций первому и пятому департаментам Сената.